La paz negativa tiene un primer desarrollo como paz de la tolerancia. Esta paz se identifica con la aceptación de todas las expresiones de la diversidad humana (de opinión, culturales, conductuales…) que no contradicen, que no destruyen, el principio de tolerancia. Priorizando el valor de la libertad y la autonomía, reconoce como legítima la pluralidad que surge de ellas, incluso si no se está de acuerdo con algunas de sus expresiones. Reconoce además que la tolerancia sólo se define y potencia de forma adecuada si se marca correctamente el límite de la misma, lo intolerable. Y lo intolerable está precisamente en el no reconocimiento del valor de la libertad, en la subordinación de la libertad de los otros a nuestras convicciones y nuestro modo de ser (personales o colectivos). La Escuela de paz se inspirará en esta paz de la tolerancia y la impulsará a través de su acción educativa. Esto significa que será neutral ante las diversas expresiones de la pluralidad de nuestra sociedad, pero que no será neutral ante la intolerancia, especialmente la manifestada en hechos de coacción violenta (en particular entre nosotros el terrorismo de ETA y su entorno), pero también la manifestada en opiniones (excluyentes, racistas, etc.).